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如何將光學(xué)顯微鏡變成奈米顯微鏡

如何將光學(xué)顯微鏡變成奈米顯微鏡
艾瑞克.貝齊格,史蒂芬.海爾以及威廉?莫納等三人得到了2014年的諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng),這是因?yàn)樗麄冊(cè)竭^(guò)了一個(gè)科學(xué)上設(shè)想的限制,也就是一個(gè)光學(xué)顯微鏡永遠(yuǎn)無(wú)法超越0.2微米的解析度規(guī)格。利用分子的螢光,科學(xué)家現(xiàn)在可以監(jiān)看在細(xì)胞內(nèi)部分子之間的相互作用;他們可以觀察與疾病相關(guān)的蛋白質(zhì)之聚集,也可以在奈米的尺度里追蹤細(xì)胞的分裂。紅血球細(xì)胞、細(xì)菌、酵母菌細(xì)胞以及游動(dòng)精子:當(dāng)科學(xué)家在十七世紀(jì)第一次開(kāi)始在顯微鏡下研究活體組織時(shí),一個(gè)新的世界在他們的眼前打開(kāi)。這是微生物學(xué)出世之際,從此之后,光學(xué)顯微鏡成為生命科學(xué)家工具箱里面最重要的工具之一。其它的顯微鏡術(shù),例如電子顯微鏡,其所需的準(zhǔn)備方法最終會(huì)殺死細(xì)胞。

發(fā)亮的分子越過(guò)了物理的屏障
然而,有一段很長(zhǎng)的時(shí)間,光學(xué)顯微鏡被一個(gè)物理的屏障所阻礙,限制了所能解析的結(jié)構(gòu)大小。在1873年,顯微鏡學(xué)家恩斯特?阿貝發(fā)表了一個(gè)方程式,證明了光學(xué)顯微鏡的解析度是如何受到光的波長(zhǎng),以及一些其它的因素所限制。因此這導(dǎo)致科學(xué)家們,在二十世紀(jì)的大半時(shí)間里,相信光學(xué)顯微鏡是永遠(yuǎn)無(wú)法用來(lái)觀察那些比所用的光之波長(zhǎng)的一半還小的物體,也就是0.2微米 (圖一)。細(xì)胞里一些胞器的輪廓,例如細(xì)胞的發(fā)電機(jī)粒線體,雖可以看到,但是幾乎不可能分辨更小的物體,因此譬如想要追蹤細(xì)胞里蛋白質(zhì)分子之間的相互作用,就無(wú)法做到,這好比能看到一個(gè)城市的建筑物,但卻無(wú)法看出市民如何的生活,和如何為其生存而努力。為了了解一個(gè)細(xì)胞如何的運(yùn)作,你必須能追蹤個(gè)別的分子如何的工作。
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圖解:圖一 在十九世紀(jì)末葉,恩斯特?阿貝定義了光學(xué)顯微鏡的解析度約為光波長(zhǎng)的一半,差不多是0.2微米,這意味著科學(xué)家能夠區(qū)別一個(gè)完整的細(xì)胞以及一些細(xì)胞內(nèi)的胞器,不過(guò)他們將永遠(yuǎn)無(wú)法分辨小到如一個(gè)正常大小的病毒,或是一個(gè)單一的蛋白質(zhì)分子。
盡管阿貝的方程式依然成立,但繞射極限的障礙仍被克服了。艾瑞克?貝齊格,史蒂芬?海爾以及威廉?莫納等三人之所以獲得2014年的諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng),就是因?yàn)樗麄兝?a href="http://www.www999938.com/search-141-0.shtml">螢光分子,將光學(xué)顯微鏡帶進(jìn)了另一個(gè)境界。理論上,不再存在有太小而無(wú)法觀察的結(jié)構(gòu)。就結(jié)果而言,光學(xué)顯微鏡變成了奈米顯微鏡。
如何規(guī)避阿貝繞射極限的故事,要分成兩條路線來(lái)說(shuō);兩個(gè)基于不同的原理所各自獨(dú)立發(fā)展出的方法,都獲得成功。讓我們回溯到1993年,在芬蘭西南部的一個(gè)學(xué)生公寓里,史蒂芬?海爾在翻閱一本量子光學(xué)的教科書(shū)時(shí),得到了一個(gè)很棒的點(diǎn)子。
 
對(duì)阿貝繞射極限的青春叛逆面對(duì)的是懷疑
自從海爾在1990年從德國(guó)海德堡大學(xué)取得博士學(xué)位之后,他就一直在尋找方法,來(lái)規(guī)避阿貝在超過(guò)一個(gè)世紀(jì)以前所訂下的限制。挑戰(zhàn)一個(gè)已經(jīng)建立的理論,這樣的想法雖很誘人,但是在德國(guó)的資深科學(xué)家們,用懷疑面對(duì)了他的熱情,導(dǎo)致了海爾往寒冷的北方尋找庇護(hù)所。一位在芬蘭特爾庫(kù)大學(xué)研究螢光顯微鏡術(shù)的教授,給了海爾在其研究小組工作的一個(gè)職位。海爾相信一定有一個(gè)機(jī)會(huì)能夠克服阿貝的繞射極限,而當(dāng)他讀到那本量子光學(xué)課本里面“受激放射”的字語(yǔ)時(shí),在他的腦海里浮現(xiàn)了一個(gè)新的想法:“在那個(gè)瞬間,曙光在我腦際出現(xiàn),我終于找到一個(gè)實(shí)際的觀念來(lái)追求 ― 一條真正的線索。”這是他于2009年自己的說(shuō)明 ― 讓我們進(jìn)入他的想法一探究竟。
 
解答:用一個(gè)奈米大小的手電筒掃描樣品
在特爾庫(kù)大學(xué),海爾在進(jìn)行稱(chēng)為螢光顯微鏡術(shù)的研究,那是一種利用螢光分子來(lái)讓細(xì)胞顯像的技術(shù)。舉例來(lái)說(shuō),他們可以使用只專(zhuān)一的與細(xì)胞的DNA偶合之螢光抗體,科學(xué)家們用一個(gè)短暫的脈沖光來(lái)激發(fā)抗體,這會(huì)讓抗體發(fā)亮并持續(xù)一個(gè)短暫的時(shí)間,如果抗體是與DNA偶合的,它們就會(huì)在細(xì)胞當(dāng)中放光,因?yàn)镈NA是塞在細(xì)胞核里面的。利用這個(gè)方法,科學(xué)家們可以看到某些分子的位置,但是他們只能定出一群聚集在一起的分子之位置,例如一些糾纏在一起的多股DNA,但是因?yàn)榻馕龆忍?,而無(wú)法分辨單股的DNA,這就好像你可以看到一卷紗線,但卻無(wú)法看出紗線是如何纏繞的。
當(dāng)海爾讀到受激放射時(shí),他體認(rèn)到應(yīng)該可以設(shè)計(jì)一種奈米的手電筒,能夠?qū)χ鴺悠芬砸淮我粋€(gè)奈米的方式掃描。利用受激放射,科學(xué)家們可以將分子的螢光淬滅,當(dāng)他們將一道雷射光束照在那些發(fā)光的的分子上時(shí),它們會(huì)立刻的失去能量而變暗。在1994年,海爾發(fā)表了一篇論文概略說(shuō)明了他的想法,他規(guī)劃的方法稱(chēng)為受激放射消去法,利用一道脈沖光將所有的螢光分子激發(fā),同時(shí)利用另一道脈沖光將所有的螢光分子淬滅,但是只有在中間的一個(gè)奈米尺度大小的體積之內(nèi)除外(圖二),因此只會(huì)取得在這個(gè)體積之內(nèi)的螢光。透過(guò)對(duì)樣品的掃描以及同時(shí)對(duì)光線強(qiáng)度的測(cè)量,就可以取得一張清楚的圖像。每一次被容許放出螢光的體積愈小,最后得到的影像解析度就愈高,因此在理論上,光學(xué)顯微鏡在解析度方面就不再有限制了。
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在德國(guó)發(fā)展頭一個(gè)奈米手電筒
海爾的理論文章并未立刻的激起一場(chǎng)騷動(dòng),但是的確有趣到讓海爾在位于哥廷根的馬克斯?卜蘭克生物物理化學(xué)研究所,得到一個(gè)職位。在接下來(lái)的數(shù)年里,他讓自己的想法開(kāi)花結(jié)果;他設(shè)計(jì)了一個(gè)STED顯微鏡,于2000年,已經(jīng)能夠展示真的可以實(shí)際的運(yùn)用他的想法,其中之一是用來(lái)取得一張大腸桿菌的圖像,并具有用光學(xué)顯微鏡從來(lái)無(wú)法達(dá)到的解析度(圖三)。
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圖解:圖三 由史蒂芬?海爾透過(guò)STED顯微鏡,最先所取得的幾個(gè)圖像之一。在左邊是一個(gè)普通的光學(xué)顯微鏡取得的大腸桿菌圖像,在右邊則是同一個(gè)大腸桿菌,用STED顯微鏡照出的結(jié)果,其解析度高了三倍。此圖
STED顯微鏡從收集一大堆很小的體積所放出的光,然后集合成一張整體的圖像,相對(duì)的比較,另一種原理也得到了成功,那被稱(chēng)為單分子顯微鏡術(shù),需要將許多張圖像重疊在一起。艾瑞克?貝齊格與威廉?莫納各自獨(dú)立的,以不同的基礎(chǔ)觀念切入,促成這項(xiàng)技術(shù)的發(fā)展。這項(xiàng)技術(shù)的基礎(chǔ),是在莫納成功的觀測(cè)到一個(gè)小的螢光分子時(shí)所奠定。
 
W. E. 莫納 ― 首先觀測(cè)到單一的螢光分子
在大部分的化學(xué)方法中,例如量測(cè)吸收和螢光,科學(xué)家們是同時(shí)觀察上百萬(wàn)的分子,在這些實(shí)驗(yàn)中所得到的結(jié)果,反映的只是一種典型平均化的分子表現(xiàn),但科學(xué)家們不得不接受這種困境,因?yàn)闆](méi)有別的可能性。不過(guò)有很長(zhǎng)的一段時(shí)間,他們夢(mèng)想著能夠量測(cè)每一個(gè)單一的分子,因?yàn)橛杏S富愈詳盡的資訊,就愈可能去了解譬如疾病是如何的發(fā)展。
在1989年,莫納成為全球第一位科學(xué)家能夠量測(cè)單一分子對(duì)光的吸收,那是一項(xiàng)具有關(guān)鍵性的成就。當(dāng)時(shí)他正在位于美國(guó)加州圣荷西的IBM研究中心工作,那個(gè)實(shí)驗(yàn)打開(kāi)了一扇通往新未來(lái)的大門(mén),并且啟發(fā)了許多化學(xué)家將注意力轉(zhuǎn)移到單分子的身上,其中之一就是艾瑞克?貝齊格,接著會(huì)在稍后說(shuō)明他的成就。
八年之后,莫納朝單分子顯微鏡邁出了第二步,那是運(yùn)用之前諾貝爾獎(jiǎng)在2008年所表彰過(guò)的綠色螢光蛋白質(zhì)。
 
分子大小的燈一開(kāi)一關(guān)
在1997年,莫納進(jìn)入了在加州大學(xué)的圣地牙哥分校,那正是后來(lái)獲得諾貝爾桂冠的錢(qián)永健所在的學(xué)校,當(dāng)時(shí)錢(qián)永健正嘗試要讓GFP放出像彩虹般的各種螢光。這個(gè)綠色螢光蛋白質(zhì)是從一種螢光水母身上分離出來(lái)的,它的好處在于能讓細(xì)胞里面的其它蛋白質(zhì)顯像??茖W(xué)家們先利用基因科技,將綠色螢光蛋白質(zhì)偶合到其它的蛋白質(zhì)上,那綠色的螢光就會(huì)暴露出這個(gè)被標(biāo)記的蛋白質(zhì)位在何處。
莫納發(fā)現(xiàn)有一種GFP可隨意點(diǎn)亮或關(guān)掉,當(dāng)他用488奈米波長(zhǎng)的光去激發(fā)蛋白質(zhì)的時(shí)候,蛋白質(zhì)就開(kāi)始發(fā)出螢光,但一個(gè)短暫的時(shí)間之后就會(huì)熄滅,在這之后無(wú)論他再用多強(qiáng)的光去照射這個(gè)蛋白質(zhì),它也不會(huì)發(fā)光,不過(guò)他后來(lái)發(fā)現(xiàn)當(dāng)光的波長(zhǎng)改為405奈米時(shí),這個(gè)蛋白質(zhì)就會(huì)恢復(fù)生機(jī),當(dāng)?shù)鞍踪|(zhì)重新活化后,它又會(huì)放出488奈米波長(zhǎng)的螢光。
莫納將這些可被激發(fā)的蛋白質(zhì)均勻的散布在一個(gè)膠質(zhì)內(nèi),讓每個(gè)蛋白質(zhì)之間的距離大于0.2微米的阿貝繞射極限,因?yàn)樗鼈兿∈璧纳㈤_(kāi)來(lái),一個(gè)普通的光學(xué)顯微鏡鏡就可以區(qū)辨每一個(gè)發(fā)亮的分子 ― 它們就好像一堆具有開(kāi)關(guān)的小燈泡,這項(xiàng)結(jié)果發(fā)表在1997年的“自然”期刊上。透過(guò)這個(gè)發(fā)現(xiàn),莫納展示了可以透過(guò)光學(xué)的方式,控制單一分子們的螢光,這解決了一個(gè)貝齊格在兩年之前所想到的問(wèn)題。
 
對(duì)學(xué)術(shù)感到疲乏 ― 但仍為阿貝的繞射極限而著迷
與海爾一樣,貝齊格也為了越過(guò)阿貝繞射極限的想法而著迷。在1990年代初期,他正在美國(guó)紐澤西州的貝爾實(shí)驗(yàn)室,研究一種新的光學(xué)顯微鏡術(shù),稱(chēng)為近場(chǎng)顯微鏡術(shù)。在此法中,光線是從一個(gè)非常薄的尖端所釋出,這個(gè)尖端與樣品之間的距離只有幾個(gè)奈米,雖然這種顯微鏡術(shù)也可以克服阿貝繞射極限,但是此法具有一些主要的弱點(diǎn),舉例來(lái)說(shuō),因?yàn)榉懦龅墓夥秶蹋灾劣跓o(wú)法看到細(xì)胞表面之下的結(jié)構(gòu)。
貝齊格在1995年得到一個(gè)結(jié)論,那就是近場(chǎng)顯微鏡術(shù)無(wú)法更進(jìn)一步的改善,此外他在學(xué)術(shù)界感覺(jué)不太自在,因此決定結(jié)束他的研究生涯;即便不知下一步要何去何從,他毅然辭職,但是阿貝繞射極限仍在他的心中。步行在一個(gè)寒冷的冬天里,他想到了一個(gè)新的點(diǎn)子;是否可能用具有不同性質(zhì)的分子,那些發(fā)出不同顏色之螢光的分子,來(lái)克服阿貝繞射極限?
貝齊格已經(jīng)能用近場(chǎng)顯微鏡術(shù)觀測(cè)到單分子的螢光,與許多人一樣,貝齊格受到莫納的啟發(fā),他開(kāi)始仔細(xì)考慮,如果使用幾種會(huì)放出不同螢光的分子,例如紅色、黃色和綠色,是否可以利用普通的光學(xué)顯微鏡得到相同的解析度。他的點(diǎn)子是讓顯微鏡每一次用不同顏色的光來(lái)記錄影像,如果同一種顏色的分子都是均勻的散布,而且相互之間的距離大于阿貝繞射極限的規(guī)范,它們的位置將可精確的決定。接著當(dāng)這些影像重疊起來(lái)時(shí),完整的圖像將具有遠(yuǎn)超過(guò)阿貝繞射極限的解析度,紅色、黃色和綠色的分子雖然相互的距離只不過(guò)幾個(gè)奈米,但仍能區(qū)別,如此就能克服阿貝繞射極限。不過(guò),仍有一些實(shí)際的困難,例如缺乏那些具有不同光學(xué)性質(zhì)之分子,其差異要大到足以相互區(qū)別。在1995年,貝齊格在 Optical Letters 這份期刊上發(fā)表了上述想法之理論,隨即離開(kāi)了學(xué)術(shù)界,并進(jìn)入了他父親開(kāi)的公司。
 
被綠色螢光蛋白質(zhì)引誘回到顯微鏡術(shù)
貝齊格完全的脫離學(xué)術(shù)界,已經(jīng)有許多年了,但是有一天,一個(gè)對(duì)科學(xué)的渴望突然又復(fù)蘇了。回顧科學(xué)文獻(xiàn)時(shí),他第一次看到綠色螢光蛋白質(zhì)的論文,體認(rèn)到有一個(gè)蛋白質(zhì),能讓其它的蛋白質(zhì)在細(xì)胞內(nèi)顯像,活化了貝齊格對(duì)如何克服阿貝繞射極限的想法。
真正的突破發(fā)生在2005年,當(dāng)時(shí)他偶然發(fā)現(xiàn)到那種可以隨意活化的螢光蛋白質(zhì),很類(lèi)似那些莫納在1997年,于單分子的層次所觀察到的螢光蛋白質(zhì)。貝齊格知道,這個(gè)分子正是可以實(shí)現(xiàn)他在十年前所想到的那個(gè)主意,所需要的工具。這種螢光分子并不需要具有不同的顏色,它們還是可以在不同的時(shí)間發(fā)出螢光。
 
藉著影像的重疊超越阿貝繞射極限
只不過(guò)一年之后,與研究可激發(fā)螢光蛋白質(zhì)的科學(xué)家合作,貝齊格展示了他的想法的確可以付諸實(shí)現(xiàn)。在一些例子當(dāng)中,他們將會(huì)發(fā)光的蛋白質(zhì)接在溶體的膜上面,溶體是細(xì)胞里的回收站,現(xiàn)在用一道脈沖光來(lái)激發(fā)出蛋白質(zhì)的螢光,因?yàn)槭褂玫拿}沖很弱,所以只能讓部分的分子開(kāi)始發(fā)出螢光,由于它們的數(shù)目很少,幾乎所有發(fā)光分子之間的距離均大于0.2微米的阿貝繞射極限,因此每一個(gè)發(fā)光的蛋白質(zhì)之位置都可以在顯微鏡下記錄。一會(huì)兒之后,當(dāng)螢光消失時(shí),他們重新激發(fā)另一組蛋白質(zhì),同樣的,使用的脈沖弱到只能讓部分的分子發(fā)出螢光,同時(shí)這一組圖像被記錄下來(lái),這個(gè)步驟一直不斷的重復(fù)。
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當(dāng)貝齊格將所有的影像重疊起來(lái)時(shí),得到了一張溶體膜的超高解析圖像,它的解析度遠(yuǎn)遠(yuǎn)的超過(guò)了阿貝繞射極限。接著,貝齊格將這一份開(kāi)創(chuàng)性的工作,于2006年發(fā)表在《科學(xué)》期刊上。
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圖解:圖五中間的圖是溶體膜的圖像,這是貝齊格用單分子顯微鏡,最初所取得的幾個(gè)圖像之一。在左邊是相同的圖,但是用傳統(tǒng)的顯微鏡所取得的。在右邊則是將膜的圖像放大,請(qǐng)注意此圖的尺度是0.2微米,等同于阿貝繞射極限,其解析度改進(jìn)了許多倍。
 
這幾位得獎(jiǎng)?wù)呷云髨D在描繪生命最深層的奧秘
這些由艾瑞克?貝齊格,史蒂芬?海爾以及威廉?莫納等三人所開(kāi)發(fā)的方法,發(fā)展出了幾個(gè)現(xiàn)在為全世界各地所使用的奈米顯微鏡技術(shù)。這三位得獎(jiǎng)?wù)呷匀换钴S在這個(gè)不僅龐大,而且一直在增長(zhǎng)的科學(xué)社群中,將創(chuàng)新的矛頭對(duì)著奈米顯微鏡術(shù)的領(lǐng)域,當(dāng)他們將功能強(qiáng)大的奈米顯微鏡瞄準(zhǔn)在生命中最小的零件時(shí),他們也同時(shí)取得了最尖端的知識(shí)。史蒂芬?海爾為了對(duì)腦突觸有更好的了解,窺探了活的神經(jīng)細(xì)胞內(nèi)部;威廉?莫納研究了與杭丁頓氏癥(舞蹈癥)有關(guān)的蛋白質(zhì);艾瑞克?貝齊格追蹤了在胚胎中細(xì)胞的分裂,這些只是眾多例子當(dāng)中的幾個(gè)。有一件事情是肯定的,2014年的諾貝爾化學(xué)桂冠得主們,對(duì)發(fā)展人類(lèi)最重要的知識(shí),已經(jīng)奠定了基石。

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