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顯微鏡下植物的直接分離組織技術(shù)

對(duì)于動(dòng)物生物種的研究來(lái)說(shuō),由于有神經(jīng)系統(tǒng),許多問(wèn)題相對(duì)容易解決,而植物則是通過(guò)組織間的信息傳遞來(lái)實(shí)現(xiàn)這種交流的,然而由于植物的組織緊密地組合在一起,要區(qū)分不同植物組織之間的功能反應(yīng),顯然不是一件非常容易的事兒。植物葉片是由不同類(lèi)型細(xì)胞所組成的復(fù)雜器官,每種細(xì)胞都有各自不同的功能。表皮細(xì)胞排列在葉的表面,下面就是大量葉肉細(xì)胞負(fù)責(zé)光合作用。此外,葉和莖通過(guò)維管系統(tǒng)連接起來(lái),運(yùn)送水和一些小分子如糖類(lèi)。今天發(fā)表在Nature上的一篇文章,就通過(guò)采用一些新技術(shù),對(duì)擬南芥葉片組織進(jìn)行全面分離,并進(jìn)行組織特異性分析,來(lái)分析植物生物鐘的信息傳遞。該文開(kāi)發(fā)了一種有效的方法,可在30分鐘內(nèi)分離葉片中三種細(xì)胞的高時(shí)空分辨率技術(shù)。在顯微鏡下觀察,分離的組織是高度純化的。通過(guò)結(jié)合分離、降解細(xì)胞壁的超聲處理和酶處理,可以大大縮短為測(cè)量RNA分離細(xì)胞所需的時(shí)間。研究人員還開(kāi)發(fā)了研究植物中時(shí)空基因調(diào)節(jié)的成像技術(shù)。他們將冷光蛋白熒光素酶分成兩半,一半是只在特定的細(xì)胞類(lèi)型中產(chǎn)生,而另一半只有當(dāng)驅(qū)動(dòng)CCA1或TOC1基因表達(dá)的啟動(dòng)子激活時(shí)產(chǎn)生。因?yàn)閮烧叨急仨氃谝粋€(gè)細(xì)胞中發(fā)光時(shí)產(chǎn)生,光的發(fā)射可作為對(duì)給定細(xì)胞類(lèi)型晝夜節(jié)律基因活性的度量。這種方法可以擴(kuò)展到其他細(xì)胞類(lèi)型和反應(yīng),如應(yīng)激和發(fā)育信號(hào),通過(guò)使用不同的啟動(dòng)子驅(qū)動(dòng)熒光素酶的兩半。顯然,這種技術(shù)有助于發(fā)現(xiàn)植物維管生物鐘與鄰近細(xì)胞的通訊和調(diào)節(jié),可以研究基因表達(dá)和高時(shí)空分辨率下的晝夜節(jié)律調(diào)控。結(jié)果表明,維管系統(tǒng)與葉肉生物鐘之間可進(jìn)行不對(duì)稱(chēng)的相互調(diào)節(jié)。維管系統(tǒng)的生物鐘與其他組織不同,具有很強(qiáng)的周期性,不受環(huán)境變化的調(diào)節(jié),并影響其他組織的生物鐘調(diào)節(jié)。
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葉由表皮細(xì)胞,葉肉細(xì)胞和構(gòu)成維管系統(tǒng)的細(xì)胞組成。調(diào)節(jié)維管組織和葉肉組織中的生物鐘有所不同。維管組織中,黑夜環(huán)路基因如TOC1比白晝環(huán)路基因如CCA1更活躍(白色箭頭表示環(huán)路),因此維管系統(tǒng)在夜間比上午有更大的整體基因活性(用黃色箭頭表示),而這種情況在葉肉組織正好是相反的。維管系統(tǒng)時(shí)鐘與葉肉組織時(shí)鐘進(jìn)行通訊和調(diào)節(jié),但還沒(méi)有證據(jù)表明葉肉組織可以調(diào)節(jié)維管系統(tǒng),這可能是一種分級(jí)控制。
多細(xì)胞生物通過(guò)它們的生物鐘調(diào)節(jié),保證細(xì)胞在適當(dāng)?shù)臅r(shí)間執(zhí)行正確的過(guò)程,周期為24小時(shí)。植物中基因活動(dòng)的時(shí)間約30%是由生物鐘調(diào)節(jié)的。一個(gè)時(shí)鐘核心由20個(gè)左右的基因組成,分為兩個(gè)連鎖途徑:在白天白晝環(huán)路出現(xiàn)活性,而黃昏后黑夜環(huán)路則開(kāi)始活動(dòng)。研究人員發(fā)現(xiàn),白晝環(huán)路如CCA1在葉肉細(xì)胞比在維管細(xì)胞中更活躍,而黑夜環(huán)路基因如TOC1則相反。此外,當(dāng)測(cè)量全基因組基因的活動(dòng)時(shí),他們發(fā)現(xiàn)了每個(gè)組織中基因表達(dá)的差異。葉肉細(xì)胞更活躍的輸出基因(通過(guò)生物鐘調(diào)節(jié))傾向于在上午表達(dá),而在維管系統(tǒng)中更活躍的輸出基因則傾向于在夜間表達(dá)。這說(shuō)明,各組織中生物鐘的差異導(dǎo)致了不同的基因表達(dá)。

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